活性定義:
用活性化的大馬哈魚精子DNA作為模板/引物,在74℃,30分鐘內,將10 nmol脫氧 核苷酸摻入到酸性不溶物質所需的酶量定義為1個活性單位(U)。
質量控制:
經過多次柱純化,SDS-PAGE檢測其純度大于99%;經檢測無外源核酸酶活性; PCR方法檢測無宿主殘余DNA;能有效地擴增人基因組中的單拷貝基因;室溫存放一個月,無明顯活性改變。
使用方法:
以下舉例為常規PCR反應體系和反應條件,實際操作中應根據模板、引物結構和目的片段大小不同進行相應的改進和優化。
1. PCR反應體系:
試 劑 | 50 μl體系 | 終濃度 |
10×Pfu PCR Buffer | 5 μl | 1× |
dNTP Mix,10 mM each | 1 μl | 200 μM each |
Forward Primer(10 μM) | 1-2 μl | 0.2-0.4 μM |
Reverse Primer(10 μM) | 1-2 μl | 0.2-0.4 μM |
Template DNA | <1 μg | <1 μg/reaction |
Pfu DNA Polymerase, 2.5 U/ μl | 1 μl | |
RNase-Free Water | up to 50 μl |
注意:
1)用Pfu酶擴增時,引物的純度要求較高,引物長度大于18個堿基,引物濃度請以終濃度 0.2-0.4 μM作為設定范圍的參考。擴增效率不高的情況下,可提高引物的濃度;發生非特異性反應時,可降低引物濃度,由此優化反應體系。
2)鎂離子濃度請以終濃度1.5-3 mM作為設定范圍的參考。本產品的10×Pfu PCR Buffer中已經含有20 mM鎂離子,可根據不同的引物對和模板來調節鎂離子濃度,由此優化反應體系。
2. PCR反應條件
步驟 | 溫度 | 時間 |
預變性 | 94℃ | 2min |
變性 退火 延伸 |
94℃ 55℃-65℃ 72℃ |
30S 30S 60S * |
終延伸 | 72℃ | 5min |
* 延伸時間可以根據產物大小調整,Pfu DNA Polymerase擴增速度為1kb/min
注意:
1)Pfu酶的熱穩定性比Taq酶好,對于GC含量很高的模板,變性溫度可以提高到98℃,對Pfu酶的活性無影響。
2)一般實驗中退火溫度比擴增引物的熔解溫度Tm低2℃,無法得到理想的擴增效率時,適當降低退火溫度;發生非特異性反應時,提高退火溫度,由此優化反應條件。
3)Pfu酶具有3′-5′外切酶活性,所以Pfu酶擴增時延伸速度遠比Taq酶低,延伸時間根據所擴增片段大小設定,本產品的擴增延伸速率為1 kb/1 min,根據目的片段大小可以適當更改延伸時間。
4)可根據擴增產物的下游應用設定循環數。如果循環次數太少,擴增量不足;如果循環次數太多,錯配機率會增加,非特異性背景嚴重。所以在保證產物得率的前提下應盡量減少循環次數。
5)本產品具有3′-5′外切核酸酶活性,PCR產物3’端不帶“A”,不能直接用于T/A克隆,如需進行T/A克隆則需要在其末端添加“A”或用平末端載體進行克隆。
3. 結果檢測:反應結束后取5 µl反應產物,加入適量上樣緩沖液后,進行瓊脂糖凝膠電泳檢測。